申请QS认证企业食品生产许可证的主要手续如下：
1、有营业执照或者企业名称预先核准通知书。
2、有与所生产产品相适应的专业技术人员和检验检疫手段（可通过咨询公司获取帮助）。
3、有与所生产产品相适应的生产条件，如生产厂房的土地证——如没有土地证需所在乡镇办理证明建设用地的手续等（可通过咨询公司进行建立和整改）。
4、有与所生产产品相适应的技术文件和工艺文件。
5、有健全有效的质量管理制度和责任制度。
6、产品符合有关国家标准、行业标准以及保障人体健康和人身、财产安全的要求。
7、符合国家产业政策的规定，不存在国家明令淘汰和禁止投资建设的落后工艺、高耗能、污染环境、浪费资源的情况。
8、法律、行政法规有其他规定的，还应当符合其规定。
9、在本省质监局网站上下载《食品生产许可证申请书》以及所申报产品所属单元的《审查细则》，如果不知如何下载或者不了解自己产品应该所属的分类，请咨询当地质监局。河南省内的企业可以向我咨询。河南省质监局的申请书一般已经分好了申报单元，并且是EXCEL格式。
10、根据《审查细则》上的要求，针对自己的厂房、设备、文件资料是否齐全，产品是否有检测报告等要求进行检查、整改、完善。
11、填写《食品生产许可证申请书》，上报质量技术监督局。
12、提交材料（QS食品企业生产许可证申请需要准备的材料）主要包括：
（1）《食品生产许可证申请书》一式三份。
（2）营业执照复印件或者预先核准通知书复印件一式三份。
（3）换证企业还需提供原生产许可证复印件一式三份。
（4）组织机构代码证（复印件）一式三份；不需办理代码证书的，提供企业负责人身份证复印件一式三份
（5）生产场所布局图一式三份。
（6）工艺流程图（标注有关键设备和参数）。
（7）企业质量管理文件一式三份。
（8）产品标准。如果产品没有国家标准，需向质量技术监督部门进行企业标准备案一式三份。
（9）申请表中规定应当提供的其他资料。
13、需要特别注意的是，《食品生产许可证申请书》封面应当加盖企业公章，复印的印章无效。
14、质监局收到申请材料后，经审验，材料符合受理标准，通知企业《行政许可申请受理决定书》；申请费用2200（同时申请两个含两个以上的每加一个加440元，但会大大增加申请通过的难度）
15、质量技术监督局指派2至4名审查员组成审查组，对企业进行实地核查，审核时间为企业应当予以配合。（一般提前五日通知企业）
16、现场审核不合格，企业应迅速整改，两个月后方可重新申请。如审核合格进入下一步。
17、封存样品，7日内由企业交付检验机构，完成检验后出具检验报告。（费用因产品种类不同不尽相同，国家收费标准）
18、根据审核提出的整改项进行整改，并对申报材料进行进一步的修改完善。
19、质监局对申报材料进行汇总，审核，申报企业等待发证。
一、15个工作日
从事食品生产加工的企业（含个体经营者），应按规定程序获取生产许可证。新建和新转产的食品企业，应当及时向食品药品监督管理局申请食品生产许可证。省级、市（地）级食品药品监督管理局在接到企业申请材料后，在15个工作日内组成审查组，完成对申请书和资料等文件的审查。企业材料符合要求后，发给《食品生产许可证受理通知书》。
二、20个工作日
企业申报材料不符合要求的，企业从接到食品药品监督管理局的通知起，在20个工作日内补正，逾期未补正的，视为撤回申请。
审查阶段
三、40个工作日
企业的书面材料合格后，按照食品生产许可证审查规则，在40个工作日内，企业要接受审查组对企业必备条件和出厂检验能力的现场审查。现场审查合格的企业，由审查组现场抽封样品。
四、10个工作日（1）
审查组或申请取证企业应当在10个工作日内（有特殊规定的除外），将样品送达指定的检验机构进行检验。
10个工作日（2）
经必备条件审查和发证检验合格而符合发证条件的，地方食品药品监督管理局在10个工作日内对审查报告进行审核，确认无误后，批准发证。
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